从朱斌率部一路进剿蜀地开始，京师的一切事物，在史可法、岳谨元和黎风等人的悉心治理下，井井有条，但由于闯贼祸乱，大批官员要么被殉国，要么因事贼而被罢免，因此各部都出现了大量的官员空缺！
朱斌回到京师后第一件事，便是急调以孔浙扬、张云乐等人为首要的大量江南官员到京赴任，这批官员被称为“江南系”。但是朱斌深知，仅靠手头现有的官员，要实现振兴大明经济、政治、军事，显然是不够的。
其后，礼部尚书张溥提议开科取士。虽为朝廷招纳贤才的做法不以为然，但目前的状况，最重要的是安定人心，而不是进行革命性的变革，因此，朱斌答应了张溥的要求，定于次年二月正式开科。
那位被从蜀地带回来的卢英，朱斌兑现了自己的诺言，为他调派了大批人手，去制作他那些曾经说过的东西。而卢英的意外发现，却也同样使朱斌对“招贤令”产生了极大的信心，很快，新的“招贤令”在大明各地公布。
在一切紧锣密鼓进行的时候，朱斌重新将目光放到了对满清的安排上。做为硕托举荐，由满清摄政王多尔衮亲自任命的特使何墨，来到京师已经有一段时间了。他的任务，就是请求大明放出被俘的英亲王阿济格，以及汉将智顺王尚可喜、续顺公沈志祥等人。
何墨一到京师，便广撒金银，结交权贵。可惜这大明的朝廷。已经不是过去的大明朝廷了，现在若无武英王点头，又有谁敢放人？
“这是愿意接收我财物。并答应帮忙者地名单，共计三十三人。”武英王府中，何墨将一份名单放到了朱斌面前，平静地说道：“另外，还有六十余名官员。不愿接受财物，我也一起都记录在了上面。”
“黎风，按照名单上写的，私受鞑子财物者，全部罢官，不受财物者，赏。”朱斌稍稍看了一眼名单，对黎风吩咐道。接着他又把目光转向了何墨：
“这些年，你辛苦了。”
何墨淡淡地说道：“为我大明朝廷做事，没甚么辛苦不辛苦的。”
“咱们在战场上地胜利。除了靠着将士们的浴血拼杀，还得靠你们这些人啊。”朱斌微微叹息了一声：“只是，你家人都已去了盛京，千万要谨慎小心。万一出了什么事情……”
何墨从容地一笑：“请武英王不必操心，何墨自接受任务以来，不要说自己的生死，家人的生死也从未放在心上。他们既身为何墨家人。便应该做好了一切准备。”
黎风有些不忍心地摇了摇头，这些黄溪一手培养出来的人。一个个便如同黄溪本人一般，坚忍、不屈，甚至残酷。他们漠视自己地生命，也同样漠视家人的生命。在他们的眼里，永远都只有一样事情的存在。那就是他们身上所肩负的任务。
“好了。这些事情先不说了。”朱斌让何墨坐了下来：“释放阿济格等人的事我会去安排的，顺便也把尚可喜和沈志祥放了。嘿嘿。当日这两人擒拿阿济格，以求活命，阿济格对这二人恨之入骨，现在随阿济格一同回去，我倒真想看看他们的主子会如何对待他们……”
何墨僵硬地笑了一下：“王爷，目前鞑子处形势比较混乱。本来多尔衮势大，鞑子诸王中虽然有人对其专权心存不满，但皆因他强大的力量而只能隐忍心中，但现在的情况却不一样了。多尔衮屡败，新得地四镇又都丢了，因为鞑子朝野对他的非议也都多了起来，而这也正是他急着要救回阿济格的原因，他现在最缺的就是对他忠心不二的帮手。他又加封多罗豫郡王多铎为和硕德豫亲王，以收其为羽翼。此外，由于鞑子兵员缺失严重，吴三桂等汉将也都开始被他重用。”
一听到多铎的名字，朱斌的脸色有下就阴沉了下来，他想到了多铎一手导演地，那惨绝人寰的“扬州十日”。虽然现在历史已经在自己地努力下发生了改变，但多铎这样的人，却早晚要为他所作过的一切还债！
“吴三桂现在怎样？”朱斌定了下心情，问道。
何墨未加考虑便道：“吴三桂自到盛京后，多尔衮特许他从汉八旗中精选出了一万士卒，重整他的关宁军，现在加上山海关的败兵，吴三桂重新拥兵两万八千余人，目前正在想方设法追剿登陆地我江南水师！”
朱斌点了点头，嘱咐了何墨几句，便让他下去休息。满清目前地形势他通过各种渠道知道得清清楚楚。满清八旗之中，两红旗的首领老地老，小的小，目前基本发挥不了什么作用。
而两白旗的多尔衮，以及过去支持豪格的两黄旗的图尔格、索尼、图赖等人，与多尔衮的矛盾，很快便因为清军的山海关之败而变得尖锐起来。
正蓝旗举棋不定，多有支持两派的人，而在这个时候，镶蓝旗的旗主济尔哈朗的态度一下变得异常重要起来。要说起这位济尔哈朗，当初也曾和朱斌在边上交过手，还被朱斌一把大火烧毁了军粮，也算是个老对手了。
他从小由努尔哈赤加以抚养，所以他与努尔哈赤的儿子们关系很好，尤其是与皇太极的关系更是非同一般。济尔哈朗从青年时代起就追随努尔哈赤南征北讨，因军功受封为和硕贝勒。是努尔哈赤时期共柄国政的八大和硕贝勒之一，也是皇太极时代四大亲王之一。
这人在满清中地位非常高，但却为人谨慎。当在皇太极暴毙后，为帝位问题两白旗和两黄旗发生尖锐对立。剑拔弩张的时候。在继统的大是大非问题上，济尔哈朗不愿卷入太深。他先是赞同立豪格为帝地意见，继而看到两种势力势同水火。又转为调和的立场。
当福临登基后，济尔哈朗辅助多尔衮，处理朝政。福临即位时，济尔哈朗与多尔衮两人同为辅政王。但尽管拥有崇高的军功、威望和地位，济尔哈朗为人很是低调。他主动要求将自己排在多尔衮前面地名次放到多尔衮之下，并要求诸王大臣商讨国事时，只报告多尔衮即可，不必报告自己。
济尔哈朗办起事来一向兢兢业业。担任辅政王后，他在盛京尽心辅佐幼帝，多尔衮则率领大军兵发山海关。当江南军水师登陆，济尔哈朗竭力保着盛京不出问题，只派人急速通知多尔衮回兵救援，却坚决不肯出战。
这种不求有功，但求无过的态度。虽然遭到了盛京大批鞑子官员的反对，其实却是个非常正确的做法。在当初朱斌的设计里，一旦满清派兵追剿，即可趁着盛京兵力空虚地时候，趁机直捣盛京，但济尔哈朗保守的做法，却使这一作战思路落空。
其后多尔衮领败兵回援。也许是为了转移作战失败的责任，他却在朝会时大加指责济尔哈朗正确的做法。两人本同为摄政王。多尔衮对待济尔哈朗却如同下属般横加指责，让镶蓝旗的满人愤愤不平，纷纷请求济尔哈朗发难。
但济尔哈朗出于清军新败，满清政局急需稳定的考虑，却拒绝了部下们的要求。他的这一从大局考虑。委曲求全的做法。却进一步增长了多尔衮的嚣张气焰……
一个人地忍耐总是有限度的，当被逼到走投无路的时候。再老实的人也会奋起反击，而这也正是朱斌最愿意看到的，所以他一直在等，等到济尔哈朗忍无可忍的一天，那时候，将是朱斌给予满清致命一击的绝妙机会……
是日大明朝会，文武大臣早早赶到，分立两旁，幼小地景平帝端坐上方，武英王朱由斌特许带刀上殿，坐在了下首的位置。
朝会上也是追增了一批国难中壮烈殉国地大臣。接着对山海关大战、追剿闯贼，收复宁远四城，平定张献忠之乱，以及南京之变中的有功人员分明嘉奖提升。
收复宁远四城有功，但却因“放跑”硕托而受到责罚的黄溪等四镇总兵，也都被撤消的处分。前江南军的一众将领，大部赐将军号，四镇总兵，并陶海、龙默寒、魏重义、龙淄阁、李德等人皆晋爵位。
这大大稳固了江南军各级将领在大明军队中地地位。接着，朱斌正式宣布，自今日起废除“江南军”称呼，统称明军。并宣布一年内募兵一百万，二十万朝廷正规军，八十万为预备军地庞大计划！
这一个有些意外的决策，当时就遭到了一些大臣地反对。武英殿大学士史可法的反对最为激烈：
“臣不赞成武英王的做法。眼下大战才平，各地凋敝，民不聊生，最紧要的是将朝廷不多的银子投入到各地的恢复之中，以安民心。按武英王扩军百万的想法，即便招募一兵最低费用年饷四两银子，这笔费用便需要四百万两。先不说这笔银子若是用到恢复经济上能起到多巨大的作用，就说朝廷又上哪去筹措这笔银子？先帝平叛十七年，国库早就用尽。闯贼入惊，烧杀劫掠，京师民众苦不堪言。自恢复京师以后，陶海运来了一批银子以安定民心，但又哪里够用？现在国库仅剩存银八万两了啊，就快连官员的俸禄都发不出了！”
朱斌皱了皱眉头，不想大明的财政状况却恶化到了这个样子。
这时，一位侍郎也上来说道：“臣赞成史相的意见。眼前边关稳定，流寇已灭，还要养那么多的军队做什么？况且所谓的预备军，臣实在闻所未闻……”
张溥却是坚定地站在了朱斌这一边：“边关虽然稳定，但金虏尚在。臣同意武英王扩军决议，我等焉可因一时之小安，便把当初的耻辱忘在脑后？”
等众人纷纷说完，朱斌这才对众大臣说道：
“第一，我已急命陶海，从江南再次调用两百万银子，以供朝廷使用。第二，恢复大明经济和地方秩序，不是靠使多少银子便有用的，稍后几天我会有详细的计划以呈圣上……”
他这话让众人无可指责，那江南本来就是武英王的封地，现在却一再从自己的封地上调用银子到朝廷，也算当得起“忠义”二字了，这时，又听朱斌说道：
“还有重要一点，要让军队有战斗力，就得让士兵们无后顾之忧。因此，每位士兵的饷银不是史大人说的四两，而是边关等重镇的士兵年饷银二十两，正规军年饷十两，预备军年饷六两。有战事发生，预备军转入正规军，年饷亦是十两……”
他的话顿时引起了朝廷一片惊讶地议论之声。这么庞大的计划，这么丰厚的军饷，得要花上多少银子？这还仅仅是初期募兵费用，今后每年朝廷都得用这么多银子！
朱斌向他们摆了摆手：“此外，各军兵士家眷，每年也可得到二两银子安家费，但凡有战场阵亡将士，皆可因等级及战功，得到不同程度的抚恤金！”
“银子，请问武英王这银子从什么地方来？”史可法大声问道。
朱斌笑了一下，说道：“初期招募士兵费用，皆由江南承担，缺多少，江南就运多少，其后朝廷所养之军，若到时大明经济仍无好转，也还是由江南全部承担！”
