“有七个金碗交给七位天使，碗内盛满了上帝的烈怒。头六碗倒进地里、海河中，也倒在日头、野兽的宝座。敌基督的军队聚集到哈米吉多顿。第七碗给倒在空气之上，世上各国纷纷倾倒。”七碗灭世的过程，因为七名使徒的死亡而被逆转，但是现在的联合队却无疑巧妙地取代了“敌基督的军队”的地位，而第三新东京市则取代了“哈米吉多顿”的地位。即使是以南宫影的智慧，也不得不赞叹萝拉的心思缜密程度，连敌人都利用的人是最可怕的。
闲话休提，至此《启示录》的过程差不多算是完蛋了，因为“最终审判”已然完成，现在还活着的“人类”都拥有了“神”所赐下的豁免权，“人类补完计划”在“一千年”这个不知道具体是多久的时间概念里将无法实现。初号机头顶的狄拉克之海已然关闭，寓意新轮回的开始，接下来就应该是《创世纪》的过程了。
而要开启创世纪过程，势必就要让南宫影成为神，这可是比“天使坠落”要困难无数倍的术式，理论上是无法完成的，但是借用这个世界真正存在的天使，萝拉十分巧妙地基于“神子受难”的术式完成了这个“成神”术式。耶稣受难三日后复活，但是并非复活在人间，而是回
归了天堂，十字教教义，天父耶和华乃“圣父圣灵圣子三位一体”，耶稣就是这个“圣子”。萝拉的计划就是让南宫影借用初号机的“圣子”地位。在受刑之后以“圣子”的身份回归天堂，而“三天”这个概念。由渚薰他们三个“天使”来强行取代，问题应该不大。
葱娘已经成功的操纵了九台量产机...里面的傀儡驾驶员，要不然这个双马尾绝对超神了。而初号机爆发出的AT力场也成功召唤了最终教条区的朗基努斯，现在这把鲜红色的巨型叉子已经响应召唤，稳稳地停在了初号机的脖颈前，完成了“神子受难”最终阶段的准备。被葱娘操纵的量产机则是按照计划用伪朗枪贯穿了初号机的双手，刻下了“圣痕”，并咬着初号机背后的十字架向着平流层飞去。
“嘶...还挺疼。”南宫影甩了甩手。没想到在这个世界自己居然享受了两次穿手之刑，不过也算是他自找的。达到预定高度之后，量产机立刻松开了初号机，以卡巴拉生命树的排列方式飞在空中，并开放了自身的S2机关，与同样开放S2机关的初号机一起，召唤世界根源的降临。而事情也很顺利。卡巴拉生命树的图样成功的浮现在了高空，不是书本上的图画，而是真正的世界根源意识。
仪式完成的同时，就在地下世界爆发了规模巨大的爆炸，作为人类认知中“天堂”的象征，深埋于地底的“黑之月”暴露了出来。受到黑之月的感召。位于地底的巨人莉莉丝也膨胀了起来，并且顺手同化了零号机和阿米沙尔，几乎毫无过程的变成了丽的样子。以遮天蔽日之势长到了初号机的高度，丽作为“圣母”，在整个仪式中存在的价值除了完成“三天”这个意义之外。另外一个目的就是赋予初号机也就是南宫影真正的“圣子”地位，作为“行刑者”的量产机已经没用了。
“接下来。就让这空无一物的躯干，去承受人类的祈愿，去祈祷人类希望的事情！”随着丽面带微笑的笼上了双手，南宫影做出了整个仪式中对他来说最为危险的部分：放弃自我，以暗喻圣子的死亡。随着这一步的完成，南宫影已经进入了假死的状态，当然如果萝拉的仪式出了什么岔子的话他可能就真的死了。而朗枪也插入了初号机的核心化为了原初的生命之树，完成了“神子受难”的最后一步。
接下来的事情，南宫影已经不知道了，他将自己的生命完全交给了剩下的人。但是这并不妨碍仪式的继续进行，与“圣母”丽一起化身巨人的，还有作为“圣父”的亚当也就是渚薰，他巨大的双手中还捧着力天使。“亚当”作为天父按照自己的形象塑造出的第一个人，本身便拥有着“圣父”的属性，加上司掌“神之力”的力天使塞路尔，这对儿组合在仪式中可以完全取代“圣父”的地位。
紧接着，同步轨道上的鸟天使降了下来，地面上的二号机也飞了起来。可以窥探人心灵的鸟天使，加上完全没有自我的霞天使，正好可以作为“神”与信仰的连接，也就是“圣灵”而存在。“圣父圣子圣灵”三位一体便可成就真神，当然明日香和渚薰是不需要合体的，你们当力天使和鸟天使是干什么的？
三位一体的仪式已然完成，作为天堂象征的“黑之月”也缓缓的被丽捧了上来，整个仪式场完全上升到了外层空间，作为献祭的“圣父”力天使和“圣灵”鸟天使全部被初号机化身的生命之树所吞噬，然后缓缓沉入了黑之月。“造神”仪式已经基本成功，但是我们的主角却依然在假死状态中，这是整个仪式最难的一道坎儿：圣子是否能夺得“神明”力量的掌控权，现在没有任何人能知道。
血色的LCL之海中，南宫影正再缓缓的飘荡，他的身边则站着三个尚显稚嫩的身影。
“这就是你所追求的么？失去了形体，失去了意志，失去了一切。”
——那么你又在追求什么呢？自由天使塔布里斯。追求绝对的自由么？别说傻话了...人的存在是因为能被别人感知到，这个道理放在使徒身上也是通用的。不被人感知到，你的自由又有何意义呢？没有任何存在能够证明你的自由。
“不错的想法，那也许正是我所追求的也说不定。”
——但是你真的做得到么？没有了别人的世界。与没有了自我又有什么区别？AT立场的存在并不仅仅是为了将人与人分隔开，更是为了能让人互相感觉到对方的存在。哪怕互相伤害。但至少这份存在的记忆并不虚假，人的存在需要互相印证，就像是取暖的豪猪，虽然疼痛，但是真实。没有了人类的祈祷，神便不再是神，你只是一个小小的天使，那种虽然绝对但是虚假的自由。你承担不起。
“世界被悲伤所充斥，人们被空虚所笼罩，而人的心将被孤独所掩盖。人与人会相互伤害，也会相互背叛，没有人可以了解别人，不会有人像你一样的善良。即使如此，你也要回去么？你的手为了什么而存在？你的心又为了什么而存在？”
——丽么？连父亲都不叫。我回去可要收拾你喽！世界也许依旧丑恶，但是那些美好的事情，也不是虚假的不是么？宁叫天下人负我，休叫我负天下人，我只求问心无愧罢了，而且无论如何。你们都不会离开我不是么？我的手，为了仅握生命的力量而存在；我的心，为了守护世间的美好而跳动。
“总是背负这些的话，会很沉重的吧？如果痛苦的话...也可以放弃；如果不愿意的话...也可以逃走；渴望解脱吧？期望得到安宁吧？”
——死也不要！我的生命可不仅仅属于自己，为了你...也为了大家。我要活着。
“不知道是该说恭喜还是该说遗憾，为了保全自身的存在。却放弃了真正的自由。”南宫影从LCL之海中站了起来，十分不科学的站在了海面上，正对着掐笑嫣然的渚薰：“自由？那种东西代价太大了。没有人是自由的，与家人的羁绊，与朋友的羁绊，与爱人的羁绊，享受着这些的我，可不愿意去承受自由的代价啊。我的存在，我所拥有的爱，也不是小小的‘自由’就能取代的！”
“即使ATField再次伤害你和其他人，你也依然要回归么？”
“正是因为互相伤害，正是因为彼此间的不同，我们才能察觉彼此的存在不是么？人类会相互理解的，即使不使用人类补完这种方法，哪怕只是我的一厢情愿，哪怕这都是装给别人看的。即使总有一天依旧会背叛，即使在那一天依然被被抛弃，但是，那时的心情一定是真实的吧？”南宫影淡笑了一下，“梦是现实的延续，现实是梦的终结，在虚幻中他逃避现实，依然有一个尽头不是么？没有一个人的世界，一点都不美好，人类生而美丽，正是因为彼此之间都是不同的，即使这种不同会互相伤害，这也不是我们编造理由报复现实的借口。不过说起来，在我的心中你们是什么？应该不是我乖巧可爱的女儿们吧？”
“是希望，是你心中所存在的希望，人与人互相理解的希望。”
黑之月，代表着人类起源的黑之月，缓缓地崩解了。一道又一道血色的线条划过，将黑月完美的划分为了一个个小方格。从这些线条中不断的溢出血色的LCL溶液，正如它刚刚来到地球时一样，当初它为为地球带来了无数的生命，包括人类在内，如今，它将以同样的方式，修复饱经创伤的世界。
黑月上的血痕越来越密集，最终整个星球崩溃成了一团红色的光点，这些光点正是第二次冲击时，死去的人与动物的灵魂，也正是这个世界被封印起来的星球意志，如今它们又重新回归了地球的怀抱。两名白色的巨人，丽和渚薰则伴随着这些红色光点的下落，和二号机一起回到了地面。在原地只留下了已经取得神之格位的初号机，更准确的说是南宫影，因为他们使用的是同一个灵魂。
“现实存在于未知之中，梦存在于现实之中，真实存在于心中。因为人类自身的形象是由人的心所塑造，而新的意向，将改变人类的灵魂和形态，意向，想象力，我们的未来，是凭借着时间洪流开拓的。只是，人类如果不靠自身的意志行动，那么什么都不会改变。失去了自己的形态，只能靠着自身的力量寻回，即使是失去了自身的观点，或是被他人的言论所迷惑也是一样的。”
因第二次冲击被补完的一半人类和动物的灵魂全部回归了地球，但是南宫影并没有动用“神”的权利让他们复原，即使他可以做到，他也不会去这么做。灵魂上的自由是上天赐给每一个生命最公平的权力，即使是“神”也不能肆意玩弄，究竟要不要回复自己的形态，要靠他们自己决定，南宫影能且唯一能做的，仅仅是给他们一个选择的机会罢了，别的什么也不能做。
初号机身上的装甲猛然炸裂开来，露出了灰棕色的狰狞原貌，张嘴伴随着一道血雾吐出了朗基努斯之枪，同时背后出现了天使之翼形状的AT力场。初号机，同时也是南宫影伸手握住了枪杆，将之折成了四分体的形状，这种形状象征着生命的再次繁衍。一道光芒闪过之后，地球上红色的LCL之海开始缓缓的退色，笼罩在南极上空的血色能量也开始退去，海洋将不再是生命禁区，相信总有一天，这里又会像冲击之前一样，变得绚丽多姿生机勃勃了吧？
只要能用自己的心给自己塑造形象，任何死于二冲的生物都可以恢复原形，这是南宫影作为“神”给予这些生命的选择权。任何生物都有着恢复样貌的力量，都有着希望活下去的心，只要能想着活下去，无论在哪里都是天堂。只要还活着，无论在哪里都有获得幸福的机会。只要太阳月亮地球还存在，一切都会有希望。
“辛苦了，老伙计。”初号机耗尽了力量，变成了好像岩石一般的雕塑，和朗基努斯之枪一起变成了漂浮在地月引力平衡点的太空垃圾。南宫影漂浮在外层空间中，满脸感怀的抚摸着初号机的大脸，这张大脸并不美丽也并不光滑，但是却十分的亲切。在这个世界呆的时间并不长，和初号机相处的时间比不上以前的任何一台高达，但也许是因为初号机有生命的关系，南宫影依然不由自主的将它当成了自己的战友，“下面还有我所牵挂的人，虽然对不起，但也只能说抱歉了。”
南宫影离开了，那里还有着挂念他的家人，那也是支持着他不断走下去的动力。初号机依然静静地飘浮在那里，似乎是在守望着这个满目疮痍的世界，伴随着碇真嗣经历了一次又一次的轮回，这台机体也应该休息了。时至今日，终于寻找到了崭新的黎明，它应该也可以安心的休息了吧？(
